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丹麥工業(yè)大學(xué)使用TigerGraph助力發(fā)現(xiàn)更有效的急性淋巴細胞白血病療法
來源:TigerGraph    作者: 閱讀:4451 日期:2021-03-31

2021年3月31日,圖分析平臺提供商TigerGraph宣布,全球技術(shù)和自然科學(xué)領(lǐng)域的領(lǐng)先大學(xué)丹麥工業(yè)大學(xué)正在將TigerGraph的高級圖分析與機器學(xué)習(xí)和人工智能(AI)技術(shù)結(jié)合,以改善急性淋巴細胞白血病的治療效果。

作為丹麥和瑞典的重大合作項目,丹麥工業(yè)大學(xué)的研究人員旨在為患有兒童癌癥的每個人繪制遺傳物質(zhì)結(jié)構(gòu)圖。同時,該項目還是歐盟資助的iCOPE(區(qū)域間兒童腫瘤精密醫(yī)學(xué)探索)更大合作項目的部分,研究過程從患者血液測試開始,通過全基因組測序(WGS)與RNA-seq表達數(shù)據(jù)配對,用于發(fā)現(xiàn)與增強子突變相關(guān)或可能由其引起的異常表達模式。iCOPE的長期目標(biāo)是改善癌癥兒童的診斷、治療、治愈率以及整體生活質(zhì)量。

研究過程生成大量數(shù)據(jù),而使用TigerGraph將這些數(shù)據(jù)與患者的生活、疾病和治療的各種其他數(shù)據(jù)點關(guān)聯(lián)在一起,以便在更大程度上了解兒童患癌癥的原因,并盡早提供診斷和更有效的治療。

丹麥工業(yè)大學(xué)癌癥系統(tǒng)生物學(xué)系衛(wèi)生技術(shù)系博士Jesper Vang解釋說:“我們當(dāng)前的系統(tǒng)僅包含原始數(shù)據(jù),例如基因型和全基因組測序數(shù)據(jù)。這些原始數(shù)據(jù)通過自定義管道運行,該管道調(diào)用遺傳變量并在MySQL數(shù)據(jù)庫中注釋數(shù)據(jù)。但是,我們需要專門為臨床人員使用的更輕松的工具,使他們能夠查找遺傳關(guān)聯(lián),而這正是圖分析的理想用例。” 

丹麥工業(yè)大學(xué)傾向選擇能夠提供所需性能的本地圖數(shù)據(jù)庫平臺,他們評估了許多選項,尤其是Neo4j。但評估的最終結(jié)論是,只有TigerGraph可以擴展并提供項目所需的分析深度。Vang繼續(xù)解釋說:“在我們的測試中,Tigergraph是唯一提供最高性能并能夠擴展到我們最終所需水平的解決方案?!?/span>

丹麥工業(yè)大學(xué)正處于整個系統(tǒng)上線的最后階段,并且已經(jīng)在結(jié)合AI、機器學(xué)習(xí)和翻譯生物信息學(xué)領(lǐng)域的特定項目中使用,以創(chuàng)建可預(yù)測急性淋巴細胞白血病治療中復(fù)發(fā)和毒性風(fēng)險的模型。

TigerGraph歐洲、中東及非洲地區(qū)副總裁Martin Darling補充說:“丹麥工業(yè)大學(xué)和整個iCOPE項目的工作具有變革性,顯示了創(chuàng)新技術(shù)在臨床治療的應(yīng)用將能夠在生命科學(xué)等領(lǐng)域獲得突破性的洞察。我們很高興Jesper Vang將在TigerGraph即將舉行的Graph + AI全球峰會上介紹該項目的完整案例?!?/span>

TigerGraph將于4月21-22日在線舉辦“Graph + AI全球峰會”。作為圖分析領(lǐng)域唯一公開的專業(yè)峰會,旨在通過圖算法加速實現(xiàn)數(shù)據(jù)分析、人工智能和機器學(xué)習(xí)。峰會將涵蓋客戶案例研討環(huán)節(jié),邀請了來自全球最大企業(yè)、最具創(chuàng)新性的初創(chuàng)企業(yè)和大學(xué)的演講嘉賓。

“Graph + AI全球峰會”的主題演講嘉賓包括:捷豹路虎數(shù)據(jù)和分析總監(jiān)Harry Powell,他將分享捷豹路虎如何使用圖將供應(yīng)鏈規(guī)劃時間從三周縮短至45分鐘,并將數(shù)據(jù)的業(yè)務(wù)價值提升3倍;Forrester Research副總裁兼首席分析師Noel Yuhanna將分享不同行業(yè)的客戶洞察,通過結(jié)合基于圖的分析、AI和機器學(xué)習(xí)來驅(qū)動業(yè)務(wù)成果;NewDay欺詐策略負責(zé)人Danny Clark將解釋通過使用圖和機器學(xué)習(xí)來檢查數(shù)據(jù),識別和防止欺詐人員比以往更快地加入犯罪網(wǎng)絡(luò),以防范已知和新的欺詐集團。


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